也就是说大都失陷了元朝还有另一个政治中心上都存在。
过去包括《元史》、《明史》在内的很多传统史籍都认为ฦ明军攻克大都意味着元朝政权被推翻了。现在这种看法遭到เ了一些专家们的质疑。例如当代著名历史学者李治安先生指出“在人们的一般印象中雄踞燕山脚๐下的元大都其地位和重要性似乎超过位于蒙古草原东南边源的元上都甚至有以大都为正都上都为ฦ陪都的看法。其实这是一种误解。由于‘上都分省’（由á扈从皇帝的部分‘中ณ书省’官员组成）实是朝廷中枢组织‘都省’（即‘中ณ书省’）的核心部ຖ分由于‘上都分省’官员每年扈从皇帝ຓ在上都驻留半年左右‘发号布政罔不在焉’从而构成了实际上的全国政治中心。严格地说元代的上都和大都至少在政治上是同等重要的并没有正陪主次之ใ分。因皇帝岁时巡幸上都和大都是迭为ฦ政治中心或留都的。上都和大都均设有留守司就是有力证据。”
这些“团结”与“山寨”有的投降、有的抵抗到底。其中元朝皇太子爱猷识理达腊主ว持大抚军院时曾经亲自命令院事、刑é部ຖ尚书张庸练兵屯寨于房山。明军攻克大都之ใ后很多山寨放弃了抵抗。但是张庸不为所动仍效忠元朝集中兵力扼守骆驼谷这个险要处所并派遣随从到山西向王保保求援。可是援兵迟迟不来。在这种恶劣的环境之ใ下骆驼谷元军独木难支遭到เ明军的围剿而全军溃败。坚守阵地的张庸的结局是被反水的寨民李世杰捉拿而献给明军终被处死。
明军为了巩固政权对大都周围的“团结”与“山寨”进行肃清作战。所谓的“团结”、“山寨”类似于乡兵团练这是蒙古贵族为了对付各地的起义แ军而在13๑57年让各路、府、州ะ、县的地方官组建的。一些“团结”、“山寨”甚至设立万夫长、千夫长、百夫长等军衔“编立牌甲â分守要害互相策应。”
明军从大都齐化门外填平壕沟登城而入非常顺利地攻克了大都。但城内局势一度混乱ກ例如在太庙里守护神主的元太常礼ึ仪院使陈祖仁在逃往健德门时为乱ກ军所害。
大都城共有十一个ฐ城门历来由元军中的“怯薛”轮番๘守卫（“怯薛”乃元帝的宿卫之士绝大多数是贵族、功臣之后其职位是世袭的享受优厚的待遇。守大都城门的“怯薛”蒙古语叫做“八刺๐哈赤”意思是“守门者”）。不过此时的“怯薛”军已๐经跟随元顺帝ຓ出走了留下来守城的仅剩下一些羸弱士兵而已（此事在《元史朴赛因不花传》有记载“大明兵逼近京师皇帝诏令朴赛因不花带兵守卫顺承门但他所领的兵仅有‘数百羸卒’而已๐。他因而叹息着对身边的人说‘国事到เ了这个地步我唯一能ม做的只是与城门共存亡了’”）。
朱元璋完全同意徐达的看法他特别指出北方土地平旷有利于游牧民族的骑兵作战为了确保万无一失应该选派精兵良将为先锋而水陆大军则紧跟其后全军依靠山东的粮食来供应军饷由秦趋赵经临ภ清地区转而北上直捣元都使敌军陷入外援隔绝、孤军作战的困境从而夺取最后的胜利。